Shadow Man, скрытый и мощный робота-ниндзя, который впервые появился в Mega Man 3. Мало что известно об этом таинственном роботе, который, по слухам, является дезактивированным роботом, созданным внеземной цивилизацией. Доказательство приходит от того факта, что тело Shadow Man не соответствует никакому материалу, найденному на Земле. Shadow Man был обнаружен доктором Вайли, в руинах, который починил и переделал его. Его Особое Оружие - это Shadow Blade, большой шурикен, покрытый смертоносным веществом, которое не с Земли и способно нарушить функцию механизмов.
Shadow Man, будучи ниндзя, обладает удивительной гибкостью, но, как известно, он довольно импульсивный и имеет поверхностный образ мышления. Shadow Man любит подкрадываться к другим, используя свои способности ниндзя, ему не нравятся очевидные и скучные трюки. Он опытный боевой мастер и мастер ниндзюцу - его способности включают в себя возможность временно создавать клонов самого себя, чтобы отвлечь или атаковать своих врагов, бросать дымовые завесы и вызывать роботов-лягушек разных размеров, в том числе гигантского робота-лягушки, чтобы передвигаться на нём. Shadow Man также может использовать Kawarimi no Jutsu, техника ниндзя, которая заменяет тело пользователя объектом, обычно куском бревна, в качестве защиты.