Mega Man Zero ist das erste Spiel einer eigenen Reihe von Mega Man-Episoden, die Zero als spielbaren Charakter aufweisen.
Handlung
Es herrscht krieg zwischen einer Armee unter der Führung eines unbekannten Mechanoiden und einer rebellischen Widerstandsgruppierung, die von Ciel aktiviert und angeführt wird. Ihr gelingt es, den seit 100 Jahren im Schlafmodus befindlichen udn gefangenen Reploiden Zero zu finden und zu reanimieren. Zero schließt sich den Rebellen an und hilft ihnen, indem er wichtige strategische Aufträge erfüllt.
Spielmechanik
Zero vollführt verschiedene Aufträge für die Rebellen, die nach und nach verfügbar werden. Er kann sie bei Ciel annehmen, die stets in der Kommandozentrale der Widerstandsbasis aufhält. Diese Aufträge beinhalten kritische Maßnahmen im Krieg zwischen den Reploids und der Armee, so wie die inbetriebnahme einer Fabrik oder die Einhaltung eines gegnerischen Truppenansturms in der nahe gelegenen Wüste.
Die für Mega Man typische Beam-Feuerwaffe ist hier eher sekundär. Stattdessen stellt sich Zeros Beam-Schwert als eine weitaus effektivere Waffe heraus. Zero kann seine Fähigkeiten durch häufiges Benutzen aufstufen und effektiver machen. Zusätzlich kann er über ds gesamte Spiel verteilt Cyber-Elfen finden, die in drei Kategorien aufgeteilt werden und diverse nützliche Effekte verursachen, beispielsweise die Heilung von Zeros Lebensenergie oder das kurzzeitige Einfrieren eines Gegners.